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详细介绍
一、产品概述
牛津纳米孔技术®的纳米孔三代测序仪GridION™ Mk1是一款紧凑型台式测序系统。它允许最多五个测序实验同时或单独进行。你可以选择一次性使用这部分资源的多寡。GridION Mk1还允许您将纳米孔测序作为服务提供。
GridION Mk1 拥有五个测序端口,可连接 MinION/GridION 流单元或带流单元的 Flongle 适配器,同时配备高性能集成计算机和基调加速器。该设备可以实时调用由五个流单元/Flongle生成的数据。当前的化学和软件支持在GridION Mk1运行期间生成多达150 Gbase的数据。
搭建GridION Mk1所需的基础设施极少,无需升级设施。新设备只需电源和通过以太网端口的网络连接。外设(如键盘和鼠标)提供三个USB 3.0接口。显示器必须通过isplayPort连接。设备通过C13线从市电供电,开机时通过前面板的电源按钮。

二、核心技术
Oxford Nanopore 测序基于纳米孔单分子检测技术。测序时,核酸分子(DNA/RNA)在马达酶驱动下,以单链形式逐个碱基穿过纳米孔。当碱基通过时,会改变纳米孔内的电流强度,不同碱基(A、T、C、G)及修饰碱基对应的电流信号存在差异。设备实时捕获这些电流变化,经 MinKNOW™等软件转化为碱基序列,实现单分子直接测序。该技术无需 PCR 扩增,可保留碱基修饰信息,且读长不受限,能实现实时数据分析,兼具便携性与高效性。

三、设备性能优势
1. 灵活性:纳米孔三代测序仪GridION™ Mk1可同时运行多达 5 个独立的 MinION Flow Cell,支持分样本并行测序或单样本多通道叠加,灵活适配多样本处理或提升数据深度的需求,大幅提高实验效率。
2. 实时数据获取:能即时生成测序数据,无需等待完整测序流程结束,助力快速获取可落地的分析见解,尤其适用于应急检测等对时效要求高的场景。
3. 集成计算能力:内置强大计算模块,可直接进行实时数据分析,无需依赖复杂的外部 IT 基础设施,降低设备部署门槛,简化实验操作流程。
4. 紧凑小巧设计:设备占地面积小,采用桌面式布局,节省实验室空间,适配各类实验室环境,无需为放置设备单独规划大面积区域。
5. 无限制读长:可对短片段到超长片段的任意长度核酸分子进行测序,不受片段长度限制,能高效解析基因组复杂结构变异等难题,突破传统短读长测序局限。
四、适用应用
1. 细菌宏基因组学:5 个独立 Flow Cell 可并行处理样本,结合超长读长,精准解析菌群结构与功能基因,48GB / 通道数据满足复杂菌群多样性研究。
2. 细菌分离株:单通道高数据输出保障分离株基因组高覆盖度,快速完成组装与注释,助力耐药基因、毒力因子等关键信息解析。
3. 细菌全基因组:无需 PCR 扩增减少测序偏好,超长读长高效解决基因组重复序列难题,为细菌进化溯源、分子分型提供高质量数据。
4. 病毒扩增子:实时数据输出快速识别病毒变异,多通道并行可同时检测多种病毒扩增子,提升病毒变异监测与流行病学调查效率。
5. 全长 16S rRNA:覆盖 16S rRNA 全长序列,避免短读长分类模糊问题,多通道支持大量样本并行,实现菌株水平精准鉴定。
6. 全外显子组:高数据量满足外显子区域深度测序需求,超长读长精准检测插入缺失等复杂变异,为遗传病、肿瘤相关研究提供关键数据。
7. 全转录组(cDNA):无需拼接即可获取全长 cDNA 序列,清晰区分可变剪切亚型,多通道并行提升低丰度转录本检测效率。
8. 较小的转录组(直接 RNA):直接 RNA 测序保留碱基修饰信息,超长读长获完整转录本序列,适配病毒、低等生物小转录组研究,快速解析转录动态。
五、适配试剂与软件
Flow Cell 兼容性:支持 MinION 系列所有 Flow Cell(如 R9.4.1、R10.4),包括 DNA 专用、RNA 专用及修饰检测专用型号;

软件生态:标配 MinKNOW™(数据采集)、Guppy(碱基识别)、Minimap2(序列比对),可兼容第三方分析工具(如 Nanoplot、Flye)。
斑马鱼(北京)科技有限公司,为您提供仪器的参数、价格、选型、技术原理等资料,欲了解更多信息,欢迎和我们联系。
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