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纳米孔三代测序仪GridION
简要描述:

纳米孔三代测序仪GridION是一款经济实惠且紧凑的桌面系统,提供按需测序和集成的实时数据处理功能。GridION Mk1 能够同时或单独运行五个流式单元,总产率高达 150 Gb,为繁忙的实验室和服务提供商提供了长读长实时纳米孔测序优势的经济实惠访问。集成的高性能数据处理减轻了对复杂IT基础设施的需求。

  • 产品型号:GridION Mk1
  • 厂商性质:经销商
  • 更新时间:2025-11-27
  • 访  问  量:42

详细介绍

一、产品概述

牛津纳米孔技术®的纳米孔三代测序仪GridION™ Mk1是一款紧凑型台式测序系统。它允许最多五个测序实验同时或单独进行。你可以选择一次性使用这部分资源的多寡。GridION Mk1还允许您将纳米孔测序作为服务提供。

GridION Mk1 拥有五个测序端口,可连接 MinION/GridION 流单元或带流单元的 Flongle 适配器,同时配备高性能集成计算机和基调加速器。该设备可以实时调用由五个流单元/Flongle生成的数据。当前的化学和软件支持在GridION Mk1运行期间生成多达150 Gbase的数据。

搭建GridION Mk1所需的基础设施极少,无需升级设施。新设备只需电源和通过以太网端口的网络连接。外设(如键盘和鼠标)提供三个USB 3.0接口。显示器必须通过isplayPort连接。设备通过C13线从市电供电,开机时通过前面板的电源按钮。

纳米孔三代测序仪GridION


二、核心技术

Oxford Nanopore 测序基于纳米孔单分子检测技术。测序时,核酸分子(DNA/RNA)在马达酶驱动下,以单链形式逐个碱基穿过纳米孔。当碱基通过时,会改变纳米孔内的电流强度,不同碱基(A、T、C、G)及修饰碱基对应的电流信号存在差异。设备实时捕获这些电流变化,经 MinKNOW™等软件转化为碱基序列,实现单分子直接测序。该技术无需 PCR 扩增,可保留碱基修饰信息,且读长不受限,能实现实时数据分析,兼具便携性与高效性。

纳米孔三代测序仪GridION

三、设备性能优势

  1. 1. 灵活性纳米孔三代测序仪GridION™ Mk1可同时运行多达 5 个独立的 MinION Flow Cell,支持分样本并行测序或单样本多通道叠加,灵活适配多样本处理或提升数据深度的需求,大幅提高实验效率。

  1. 2. 实时数据获取:能即时生成测序数据,无需等待完整测序流程结束,助力快速获取可落地的分析见解,尤其适用于应急检测等对时效要求高的场景。

  1. 3. 集成计算能力:内置强大计算模块,可直接进行实时数据分析,无需依赖复杂的外部 IT 基础设施,降低设备部署门槛,简化实验操作流程。

  1. 4. 紧凑小巧设计:设备占地面积小,采用桌面式布局,节省实验室空间,适配各类实验室环境,无需为放置设备单独规划大面积区域。

  2. 5. 无限制读长:可对短片段到超长片段的任意长度核酸分子进行测序,不受片段长度限制,能高效解析基因组复杂结构变异等难题,突破传统短读长测序局限。


四、适用应用

  1. 1. 细菌宏基因组学:5 个独立 Flow Cell 可并行处理样本,结合超长读长,精准解析菌群结构与功能基因,48GB / 通道数据满足复杂菌群多样性研究。

  1. 2. 细菌分离株:单通道高数据输出保障分离株基因组高覆盖度,快速完成组装与注释,助力耐药基因、毒力因子等关键信息解析。

  1. 3. 细菌全基因组:无需 PCR 扩增减少测序偏好,超长读长高效解决基因组重复序列难题,为细菌进化溯源、分子分型提供高质量数据。

  1. 4. 病毒扩增子:实时数据输出快速识别病毒变异,多通道并行可同时检测多种病毒扩增子,提升病毒变异监测与流行病学调查效率。

  1. 5. 全长 16S rRNA:覆盖 16S rRNA 全长序列,避免短读长分类模糊问题,多通道支持大量样本并行,实现菌株水平精准鉴定。

  1. 6. 全外显子组:高数据量满足外显子区域深度测序需求,超长读长精准检测插入缺失等复杂变异,为遗传病、肿瘤相关研究提供关键数据。

  1. 7. 全转录组(cDNA):无需拼接即可获取全长 cDNA 序列,清晰区分可变剪切亚型,多通道并行提升低丰度转录本检测效率。

  1. 8. 较小的转录组(直接 RNA):直接 RNA 测序保留碱基修饰信息,超长读长获完整转录本序列,适配病毒、低等生物小转录组研究,快速解析转录动态。


五、适配试剂与软件

Flow Cell 兼容性:支持 MinION 系列所有 Flow Cell(如 R9.4.1、R10.4),包括 DNA 专用、RNA 专用及修饰检测专用型号;

纳米孔三代测序仪GridION

软件生态:标配 MinKNOW™(数据采集)、Guppy(碱基识别)、Minimap2(序列比对),可兼容第三方分析工具(如 Nanoplot、Flye)。


斑马鱼(北京)科技有限公司,为您提供仪器的参数、价格、选型、技术原理等资料,欲了解更多信息,欢迎和我们联系。



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