COMET 全自动单细胞空间多组学平台源自 Lunaphore（现归属 Bio‑Techne 空间生物学事业部），是一套端到端全自动超高重空间多组学仪器。仪器基于自研微流控 FFex™技术，集探针杂交、多重染色、荧光成像、图像预处理于一体，单批次可同时处理 4 张组织切片，无需人工值守，放入载玻片即可自动完成全部实验流程，输出标准化 OME‑TIFF 图像文件。

一、仪器介绍：

COMET 全自动单细胞空间多组学平台将 seqIF™序贯免疫荧光与 RNAscope™ HiPlex Pro 原位 RNA 检测技术整合，在同一张组织切片上实现蛋白与 RNA 同步原位检测，达到亚细胞分辨率；蛋白检测单轮最高 40 重靶点，结合 RNA 可实现上百重生物分子联合解析，支持 FFPE、固定冷冻、新鲜冷冻多种组织样本类型，兼容人、小鼠及其他物种样本，无需对抗体进行条码标记、化学偶联，可直接使用实验室现有商品化一抗，大幅降低 Panel 开发周期与试剂成本，助力肿瘤免疫、神经科学、转化医学等方向空间生物学研究。

二、检测原理：

COMET 全自动单细胞空间多组学平台核心为微流控 seqIF™序贯免疫荧光技术，同时兼容 RNAscope™ HiPlex Pro 原位 RNA 检测流程。

微流控流体控制：自研微流控芯片将试剂精准输送至组织切片表面，试剂在组织表层快速循环流动，大幅缩短抗原抗体孵育时间，提升染色均一性；

序贯循环工作模式：每一轮完成 2 个蛋白靶标染色、荧光成像后，采用温和洗脱条件去除已结合抗体，完整保留组织形态与抗原表位，开展下一轮染色‑成像‑洗脱循环，多次循环叠加实现超高重蛋白检测；

RNA‑蛋白联合检测：同一载玻片上先完成 RNAscope™ HiPlex Pro RNA 探针杂交检测，再运行 seqIF™蛋白多重染色，系统自动完成多轮图像配准融合，实现单张切片 RNA 与蛋白质空间信息联合分析；

图像自动化处理：设备内置成像模块，自动完成图像采集、背景扣除、图像对齐配准，直接输出可用于第三方分析软件的标准 OME‑TIFF 数据格式。

※关键：洗脱条件温和，无组织消融、无光漂白损伤，切片完成 COMET 检测后，还可继续开展 H‑E 染色、普通 IHC、测序等下游实验，样本可二次复用。

三、仪器优势：

1、试剂开放，无需抗体偶联标记

直接使用市面常规非偶联一抗、二抗，不需要抗体条码标记、化学修饰；自定义 Marker Panel 开发仅需数天，区别于传统平台数月开发周期，可灵活增删标志物，充分利用实验室已有抗体资源，降低项目成本。

2、全流程无人值守自动化

从探针杂交、多重染色、洗脱、成像到图像预处理全流程自动化；单次最多 4 张载玻片并行，上机后无需人工操作，输出标准化图像，实验重复性高，减少人为操作引入误差。

3、同切片真正空间多组学，亚细胞分辨率

单张切片同时解析 RNA 转录本与蛋白表达，获取单细胞、亚细胞水平分子空间分布，实现转录水平与蛋白表达水平的关联验证，最高可实现单张切片 105 重靶点联合检测（RNA + 蛋白）。

4、优异组织保护，样本可二次利用

微流控温和反应体系，组织接触强化学试剂时间显著缩短，保留组织形态、抗原表位；完成检测后的切片仍支持 H‑E、IHC、空间转录组测序等后续实验，珍贵样本价值。

5、染色均一稳定，数据可定量

微流控流体均匀覆盖整张切片，消除孵育梯度效应；荧光信号强度和生物标志物表达量具备线性对应关系，支持细胞水平、亚细胞水平的定量分析，适配科研与转化项目数据要求。

6、样本兼容性广

支持 FFPE 石蜡切片、固定冷冻组织、新鲜冷冻组织；适配肿瘤、脑组织、骨髓、肺、胰腺等各类组织，支持人、小鼠及多种模式生物样本。

四、应用场景：

1、 肿瘤免疫研究

肿瘤微环境高维图谱解析；免疫细胞亚群分型、空间分布定位；免疫检查点、细胞因子原位表达分析；肿瘤‑免疫细胞互作研究；immunotherapy标志物挖掘、药物响应机制、TMA 组织芯片大样本队列分析。

利用RNAscope检测细胞因子、免疫细胞和肿瘤细胞，使用RNA-蛋白多组组分析。同时检测到脑TME中3个标记蛋白（CD8a、CD68、IBA-1）和3个靶RNA探针（CXCL2、IL6和INFg），蓝色：细胞核。

2、神经科学研究

脑组织复杂细胞图谱绘制；神经退行性疾病（阿尔茨海默、渐冻症 ALS 等）病理机制；神经元、小胶质细胞、星形胶质细胞空间表型分析；神经损伤、炎症相关分子原位共定位研究。

全鼠大脑切片，ALS，FS组织 Slc17a7（绿色） Chat（绿松石色） Slc17a6（黄色） NeuN（粉色） GFAP（蓝色） TSPO（红色）。

小鼠脑、海马、ALS、软冻组织。点状掩膜由 HORIZON™ Rbfox3（黄色）、Prox1（绿色）、NeuN（蓝色）、GFAP（粉色）生成。

3、 转化医学与药物研发

生物标志物筛选验证；疾病病理组织空间表型分析；候选药物作用机制评估；临床样本队列高通量空间表征，助力伴随诊断靶点开发。

4、 炎症与感染性疾病

炎症微环境细胞异质性分析；免疫细胞募集、细胞因子空间表达特征；感染病灶处宿主‑病原体相互作用研究。

5、 基础空间生物学

单细胞水平 RNA‑蛋白联合多组学；组织细胞空间图谱构建；各类模式生物组织的超高重原位分子表型研究。

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